大豆、油菜、花生等作物，不仅是我国人民食用植物油和蛋白质的重要来源，还是发展畜牧养殖业的重要优质蛋白源，在我国国民经济和社会发展中具有十分重要的地位。在国家863计划的资助下，经过两年半努力，“大豆、油菜、花生功能基因组学研究与应用”课题组取得了重要的阶段性成果。2015年6月4日，863计划现代农业技术领域办有关工作人员组织主题专家和财务专家对该课题进行了中期现场检查，项目首席专家喻树迅院士参加了检查。

“大豆、油菜、花生功能基因组学研究与应用”课题组织实施两年多来，课题组以功能基因组研究为依托，在新分子标记开发、重要功能基因克隆与应用及种质资源创制等方面取得了较大突破：在新分子标记开发方面，课题组开展了油菜、大豆、花生多种性状的QTL分析，精细定位了重要性状基因位点40多个，筛选获得新分子标记250多个，并应用分子标记技术完成了油菜、大豆、花生导入系和突变体的创制与评价；在重要功能基因克隆方面，课题组通过图位克隆技术获得了18个油菜、大豆重要功能基因，特别是通过精细定位，课题组鉴定出一个油菜粒重调控基因RSW1， 该基因属于生长素应答因子，可以通过抑制生长素下游基因影响细胞生长， 过量表达该基因可以改变种子重量和角果长度，该研究结果为油菜高产品种选育提供了重要理论基础和技术支撑，课题组还发现油菜的BnC3CCD4基因变异决定了花色差异，该类胡萝卜素裂解双加氧酶基因的突变导致花瓣中黄色类胡萝卜素不能降解，进而积累成黄色花瓣，该成果揭示了芸薹属物种花色形成的分子机理，为通过基因工程手段选育多花色油菜品种，发展观光农业奠定了基础；在种质资源创制方面，课题组应用分子标记辅助选择技术培育出大豆和花生新品系各2个，并通过遗传转化获得了表型好、应用前景广的转基因油菜、大豆品系3个，为课题后续新品种选育奠定了良好的基础。

专家组认为，课题组在建立油料作物分子设计育种平台，发掘油料作物高产、高抗功能基因及分子标记方面取得了重要阶段性成果，为培育油料作物新品种，缓解国内食用油供给不足奠定了良好基础，同时，专家组指出课题组应进一步加强课题内部交流合作，突出研突出重点，加强重大成果的培育。